Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms