Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM30A4D0T7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM30A4D0T7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM30A4D0T7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms