Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms