Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV2-40A0A087WW87 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV2-40A0A087WW87 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV2-40A0A087WW87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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