Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNKQ9P0W0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms