Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms