Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms