Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms