Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms