Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOPBP1Q92547 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms