Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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SCG3Q8WXD2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SCG3Q8WXD2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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