Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PLD3Q8IV08 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms