Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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