Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM78BQ5VT40 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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