Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLAMF7-205ENST00000444090 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TRERF1-203ENST00000372917 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 JAK3-207ENST00000534444 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms