Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms