Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HADHQ16836 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms