Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RTN1Q16799 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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