Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms