Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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