Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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