Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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