Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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