Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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