Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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