Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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