Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms