Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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