Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TROQ12816 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TROQ12816 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TROQ12816 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TROQ12816 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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