Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms