Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms