Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC092807.3-202ENST00000498304 508 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC116359.1-201ENST00000510731 1099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MS4A6A-216ENST00000532169 1136 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC112484.4-201ENST00000567253 811 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms