Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms