Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HADHBP55084 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HADHBP55084 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms