Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms