Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms