Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF6P49848 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms