Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms