Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms