Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AFMP43652 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AFMP43652 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AFMP43652 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms