Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms