Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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CRABP1P29762 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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