Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms