Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRMP28827 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRMP28827 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRMP28827 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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