Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTSSP25774 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms