Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms