Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms