Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SERPINC1P01008 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms