Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1AO95602 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms