Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms